Siseriiklik koostöö
Kaitseväe Akadeemia teeb haridusalast koostööd Eesti Lennuakadeemia, Eesti Mereakadeemia ja Sisekaitseakadeemiaga.
Välisriiklik koostöö
Akadeemia peamised koostööpartnerid on kaitsejõud, sõjaväeakadeemiad, uurimisasutused ja ettevõtted Läänemere äärsetes riikides ja Eesti strateegilistes liitlasriikides NATO-s.
Akadeemia on Euroopa julgeoleku- ja kaitsekolledži ohvitseride kõrghariduse esimesele tasemele suunatud võrgustiku liige.
Samuti osaletakse NATO erinevates programmides nagu Põhja-Atlandi kaitsevaldkonna innovatsiooni kiirendi ja sõjaväelise hariduse arendamise programm.
Lisaks on Kaitseväe Akadeemia kadetid edukalt osalenud üleeuroopalisel välis- ja julgeolekupoliitika teemalisel olümpiaadil. Õhuväe kadetid on regulaarselt sooritanud liitlaste juures ka välispraktikat, nt Islandil, Ungaris ja Baltikumis. Samuti on meie kadetid tihedad külalised teistes sõjaväe akadeemiates, seda nii kadetivahetuse, rahvusvaheliste nädalate või erinevate tähtpäevade raames.